Миссия Junibrux – способствовать утверждению идеалов свободы, справедливости и демократии, строить открытое общество в недемократических странах, стремиться к созданию равноправного мира. Содействовать модернизации человеческого общества и расширению границ знаний посредством сохранения и приумножения гуманистических, моральных и социокультурных ценностей.

Обучать профессионалов высокого уровня, генерируя передовые идеи и лучшие технологии в области образования и социальной работы. В своей научной, образовательной и социально-правовой деятельности он полностью солидарен с неоклассической моделью университета, созданной Вильгельмом Гумбольдтом и рассматриваемой в контексте сформулированных Хосе Ортега-и-Гассет парадоксов, связанных с функциями университетов. В частности, то, что университеты создают не только социально значимое благо в виде профессиональных навыков будущих специалистов, но и несут в мир либеральные ценности и культуру.